MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 56234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AAATT	2	10	24	33	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005861	TTAA	2	8	45	52	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005861	AGA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445635
4	NC_005861	TAT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445635
5	NC_005861	AGC	2	6	186	191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445635
6	NC_005861	A	6	6	192	197	100 %	0 %	0 %	0 %	46445635
7	NC_005861	T	6	6	219	224	0 %	100 %	0 %	0 %	46445635
8	NC_005861	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445635
9	NC_005861	AG	3	6	323	328	50 %	0 %	50 %	0 %	46445635
10	NC_005861	AGA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005861	A	6	6	422	427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005861	A	6	6	497	502	100 %	0 %	0 %	0 %	46445636
13	NC_005861	TGA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445636
14	NC_005861	ATT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445636
15	NC_005861	AATTTA	2	12	690	701	50 %	50 %	0 %	0 %	46445636
16	NC_005861	CTA	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005861	TTA	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005861	T	6	6	834	839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005861	TTA	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005861	TA	3	6	968	973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005861	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005861	TGAT	2	8	1037	1044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005861	TG	3	6	1056	1061	0 %	50 %	50 %	0 %	46445637
24	NC_005861	A	6	6	1077	1082	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
25	NC_005861	CTC	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445637
26	NC_005861	ATC	2	6	1119	1124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445637
27	NC_005861	T	7	7	1127	1133	0 %	100 %	0 %	0 %	46445637
28	NC_005861	A	7	7	1164	1170	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
29	NC_005861	AAGA	2	8	1173	1180	75 %	0 %	25 %	0 %	46445637
30	NC_005861	AGC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
31	NC_005861	TA	3	6	1205	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	46445637
32	NC_005861	GAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
33	NC_005861	GAA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
34	NC_005861	GTT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
35	NC_005861	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
36	NC_005861	AATT	2	8	1333	1340	50 %	50 %	0 %	0 %	46445637
37	NC_005861	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445637
38	NC_005861	A	8	8	1486	1493	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
39	NC_005861	ATT	2	6	1529	1534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
40	NC_005861	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
41	NC_005861	GTTAT	2	10	1609	1618	20 %	60 %	20 %	0 %	46445637
42	NC_005861	ATT	2	6	1664	1669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
43	NC_005861	A	7	7	1798	1804	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
44	NC_005861	TCT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
45	NC_005861	A	7	7	1829	1835	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
46	NC_005861	A	7	7	1899	1905	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
47	NC_005861	GATTG	2	10	1940	1949	20 %	40 %	40 %	0 %	46445637
48	NC_005861	ACA	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
49	NC_005861	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
50	NC_005861	CAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
51	NC_005861	AAC	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
52	NC_005861	AAAC	2	8	2126	2133	75 %	0 %	0 %	25 %	46445637
53	NC_005861	AGG	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
54	NC_005861	TTTG	2	8	2170	2177	0 %	75 %	25 %	0 %	46445637
55	NC_005861	CTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
56	NC_005861	AGG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
57	NC_005861	GAT	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
58	NC_005861	AAG	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
59	NC_005861	TCA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445637
60	NC_005861	GC	3	6	2554	2559	0 %	0 %	50 %	50 %	46445637
61	NC_005861	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
62	NC_005861	AG	3	6	2615	2620	50 %	0 %	50 %	0 %	46445637
63	NC_005861	AAG	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
64	NC_005861	AAG	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
65	NC_005861	TGA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
66	NC_005861	GAA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
67	NC_005861	TTC	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
68	NC_005861	T	7	7	2782	2788	0 %	100 %	0 %	0 %	46445637
69	NC_005861	GTT	2	6	2855	2860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
70	NC_005861	GCA	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
71	NC_005861	A	8	8	2979	2986	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
72	NC_005861	GGA	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
73	NC_005861	GTT	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
74	NC_005861	AGA	2	6	3046	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
75	NC_005861	T	8	8	3102	3109	0 %	100 %	0 %	0 %	46445637
76	NC_005861	CTTA	2	8	3150	3157	25 %	50 %	0 %	25 %	46445637
77	NC_005861	GAAG	2	8	3158	3165	50 %	0 %	50 %	0 %	46445637
78	NC_005861	T	6	6	3202	3207	0 %	100 %	0 %	0 %	46445637
79	NC_005861	TGA	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
80	NC_005861	T	6	6	3302	3307	0 %	100 %	0 %	0 %	46445637
81	NC_005861	A	6	6	3312	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
82	NC_005861	CATT	2	8	3341	3348	25 %	50 %	0 %	25 %	46445637
83	NC_005861	ATT	2	6	3452	3457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
84	NC_005861	CAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
85	NC_005861	A	6	6	3497	3502	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
86	NC_005861	CAG	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
87	NC_005861	GAAA	2	8	3574	3581	75 %	0 %	25 %	0 %	46445637
88	NC_005861	A	6	6	3579	3584	100 %	0 %	0 %	0 %	46445637
89	NC_005861	CCT	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445637
90	NC_005861	CT	3	6	3731	3736	0 %	50 %	0 %	50 %	46445637
91	NC_005861	AAC	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
92	NC_005861	TGT	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
93	NC_005861	TA	3	6	3992	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	46445637
94	NC_005861	ATA	3	9	4054	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005861	AATT	2	8	4079	4086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005861	TTTG	2	8	4091	4098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005861	ATT	2	6	4121	4126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005861	CCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_005861	A	7	7	4143	4149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005861	TC	3	6	4218	4223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_005861	ACTTTT	2	12	4240	4251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_005861	AAT	2	6	4294	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005861	TTTTC	2	10	4303	4312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_005861	A	6	6	4352	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005861	GCA	2	6	4443	4448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
106	NC_005861	CAA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445638
107	NC_005861	ACG	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
108	NC_005861	AG	3	6	4533	4538	50 %	0 %	50 %	0 %	46445638
109	NC_005861	A	6	6	4568	4573	100 %	0 %	0 %	0 %	46445638
110	NC_005861	GTG	2	6	4597	4602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
111	NC_005861	GA	3	6	4630	4635	50 %	0 %	50 %	0 %	46445638
112	NC_005861	GTG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
113	NC_005861	AATTT	2	10	4756	4765	40 %	60 %	0 %	0 %	46445638
114	NC_005861	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445638
115	NC_005861	GAAGT	2	10	4885	4894	40 %	20 %	40 %	0 %	46445638
116	NC_005861	GAT	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445638
117	NC_005861	CGA	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
118	NC_005861	ATTG	2	8	5250	5257	25 %	50 %	25 %	0 %	46445638
119	NC_005861	TGG	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
120	NC_005861	T	6	6	5393	5398	0 %	100 %	0 %	0 %	46445638
121	NC_005861	GCA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
122	NC_005861	AAAGCA	2	12	5415	5426	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46445638
123	NC_005861	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445638
124	NC_005861	A	8	8	5442	5449	100 %	0 %	0 %	0 %	46445638
125	NC_005861	GCT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445638
126	NC_005861	GGA	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445638
127	NC_005861	AAG	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445638
128	NC_005861	AT	3	6	5519	5524	50 %	50 %	0 %	0 %	46445638
129	NC_005861	TA	3	6	5607	5612	50 %	50 %	0 %	0 %	46445638
130	NC_005861	TTA	3	9	5660	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445638
131	NC_005861	AGA	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445638
132	NC_005861	AG	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005861	T	6	6	5935	5940	0 %	100 %	0 %	0 %	46445639
134	NC_005861	TCT	2	6	5953	5958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
135	NC_005861	TGA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
136	NC_005861	CGC	2	6	6021	6026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46445639
137	NC_005861	CTA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
138	NC_005861	TTCA	2	8	6087	6094	25 %	50 %	0 %	25 %	46445639
139	NC_005861	GTT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
140	NC_005861	CTT	3	9	6128	6136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
141	NC_005861	AAT	2	6	6222	6227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
142	NC_005861	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
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412	NC_005861	AGA	2	6	17712	17717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445643
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435	NC_005861	TTGAT	2	10	18539	18548	20 %	60 %	20 %	0 %	46445643
436	NC_005861	ATATT	2	10	18567	18576	40 %	60 %	0 %	0 %	46445643
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